14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2898 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2898  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2446  hypothetical protein  26.9 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0123  Polyketide cyclase/dehydrase  26.35 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2688  hypothetical protein  27.66 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0154843  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1306  hypothetical protein  29.03 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  25.52 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2330  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0431601  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2556  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1503  hypothetical protein  26.02 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2571  hypothetical protein  25.4 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2757  hypothetical protein  25.4 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2527  hypothetical protein  24.6 
 
 
152 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000180916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  33.02 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  25.44 
 
 
378 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>