42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  90.64 
 
 
376 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  62.94 
 
 
369 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  58.89 
 
 
381 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  55.16 
 
 
371 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  53.26 
 
 
371 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  53.26 
 
 
371 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  53.26 
 
 
371 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  53.46 
 
 
367 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  53.74 
 
 
367 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  53.74 
 
 
367 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  53.74 
 
 
367 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  35.19 
 
 
263 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  37.04 
 
 
235 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  36.89 
 
 
235 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  36.41 
 
 
235 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  35.44 
 
 
279 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  31.92 
 
 
271 aa  122  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  31.92 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  36.19 
 
 
228 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  31.13 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  35.65 
 
 
223 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3576  hypothetical protein  38.89 
 
 
178 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.764191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4332  hypothetical protein  36.13 
 
 
191 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  33.79 
 
 
181 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  30.88 
 
 
147 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  27.59 
 
 
152 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2298  Polyketide cyclase/dehydrase  28.7 
 
 
144 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  22.5 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  22.5 
 
 
209 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  22.5 
 
 
209 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  22.5 
 
 
209 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  21.78 
 
 
209 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  22.5 
 
 
209 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  22 
 
 
209 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  22.61 
 
 
209 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  23.2 
 
 
209 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  22.77 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3036  fatty acid hydroxylase  29.3 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4807  hypothetical protein  22.92 
 
 
143 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4513  hypothetical protein  22.92 
 
 
143 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4426  hypothetical protein  22.92 
 
 
143 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>