13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2330 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2330  cyclase/dehydrase  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0431601  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2556  cyclase/dehydrase  71.33 
 
 
144 aa  227  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2446  hypothetical protein  54.86 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2341  hypothetical protein  52.86 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  25.17 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2898  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2688  hypothetical protein  25.6 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0154843  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0123  Polyketide cyclase/dehydrase  26.19 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0811  hypothetical protein  25.69 
 
 
146 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3666  hypothetical protein  29.06 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3720  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  21.38 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000031587  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  23.39 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>