17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4200 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3576  hypothetical protein  61.93 
 
 
178 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.764191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4332  hypothetical protein  56 
 
 
191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  33.55 
 
 
371 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  32.67 
 
 
369 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 
381 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  33.56 
 
 
367 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  32.89 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  32.89 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  32.89 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  32.89 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  32.89 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  32.89 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  33.79 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  31.03 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  28.28 
 
 
152 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  26.87 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>