38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3129 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 381 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  58.54 
 
 		 369 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  58.62 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  59.73 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  51.49 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  51.76 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  51.76 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  51.76 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  52.21 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  52.21 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  52.21 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  51.93 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  37.09 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  37.16 
 
 		 235 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  35.94 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  36.28 
 
 		 235 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  33.64 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  35.05 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  36.28 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  34.93 
 
 		 223 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  31.05 
 
 		 277 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4332  hypothetical protein  33.12 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  30.99 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3576  hypothetical protein  29.53 
 
 		 178 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.764191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 		 260 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  23.61 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  26.29 
 
 		 209 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  24.58 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  23.61 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  23.61 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  26.7 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  27.06 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  23.61 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  25.56 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  24.58 
 
 		 209 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  28.19 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  22.75 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.220259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>