36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8396 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  43.88 
 
 
140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  42.14 
 
 
141 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6684  hypothetical protein  35.22 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.919976  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  31.33 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  34.74 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  34.74 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1012  Polyketide cyclase/dehydrase  32.37 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1118  hypothetical protein  33.98 
 
 
208 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392266  normal  0.775853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  28.97 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  28.67 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0158  hypothetical protein  31.46 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2322  hypothetical protein  29.73 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0510  hypothetical protein  32.95 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  28.33 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  28.33 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  28.33 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4620  hypothetical protein  41.82 
 
 
231 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.67 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  32.46 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  27.87 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1118  hypothetical protein  24.81 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222557  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  27.05 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2368  hypothetical protein  22.22 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2710  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0283018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  32.61 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.46 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7124  hypothetical protein  27.08 
 
 
139 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  24.79 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  24.75 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  24.34 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  26.83 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2586  hypothetical protein  28.04 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>