36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2872 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  76.22 
 
 		 144 aa  229  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  74.83 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  25.83 
 
 		 242 aa  48.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  28.33 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  24.5 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  24.5 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1315  Polyketide cyclase/dehydrase  26.79 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  26.39 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  23.18 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  25.35 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  25.21 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  21.48 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  26.39 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  25.35 
 
 		 216 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  23.29 
 
 		 156 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  20.53 
 
 		 232 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  26.17 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  26.03 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  32.47 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  24.66 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  22.6 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  24.65 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  23.97 
 
 		 156 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  28.15 
 
 		 152 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2865  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 145 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.95842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>