22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2865 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2865  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.95842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2432  cyclase/dehydrase  97.24 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137683  normal  0.165431 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0967  bacterio-opsin linked product  34.9 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0914  bacterio-opsin linked product  32.89 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.747207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0964  bacterio-opsin linked product  34.9 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3500  hypothetical protein  32.21 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1645  bacterio-opsin linked product  30.34 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  33.77 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  28.26 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  29.66 
 
 		 242 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  29.66 
 
 		 243 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  28 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  29.63 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  29.2 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 192 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  23.61 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  38.6 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  38.6 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 144 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 144 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  27.59 
 
 		 144 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>