17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0188 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  23.85 
 
 
152 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  28.85 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  26.92 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  29.58 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  26.45 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  25 
 
 
328 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  26.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  24.19 
 
 
156 aa  45.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  26.11 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2432  cyclase/dehydrase  28.03 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137683  normal  0.165431 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  22.69 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  29.23 
 
 
492 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2865  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 
145 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.95842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  26.75 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  33.78 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>