45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4077 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  303  7e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  56.86 
 
 
161 aa  154  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  54.23 
 
 
209 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  50.71 
 
 
166 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  43.62 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  39.74 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  35.1 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  38.03 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  40.22 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  37.65 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  37.5 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  37.8 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  35.29 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  40 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  27.97 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  37.97 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.78 
 
 
501 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  36.17 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  35.71 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  37.25 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  39.58 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  39.73 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  34.15 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  32.98 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  36.63 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  33.73 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  31.16 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  31.18 
 
 
462 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  23.4 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  38.75 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  39.44 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  26.67 
 
 
198 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  33.66 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  32.95 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  45 
 
 
149 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  30.86 
 
 
153 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
438 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  45.65 
 
 
176 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  26.15 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>