32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3582 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  316  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  33.78 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  28.89 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  30 
 
 
169 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
501 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  30.5 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  28.95 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  33.7 
 
 
209 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  34.88 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  28.79 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  34.83 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  27 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  31.19 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  28.05 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  28.24 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  39.44 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  27.85 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  23.6 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  30.7 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  24.82 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  30.23 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  29.27 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  27.35 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  31 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  31 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  28.74 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  30.43 
 
 
158 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  40 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  26.83 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>