53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1109 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.36 
 
 
501 aa  140  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  53.38 
 
 
169 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  57.26 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  50 
 
 
152 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  47.69 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  42.38 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  43.97 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 
158 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  45.11 
 
 
156 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  43.15 
 
 
154 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  39.35 
 
 
156 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  39.46 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  37.78 
 
 
152 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  38.06 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  37.41 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  34.72 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  40.6 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  32.26 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  36.55 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  37.37 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  35.38 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  31.75 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  31.75 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  35.96 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  36.94 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  32.2 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  36.27 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  30.17 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  36.89 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  29.46 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  31.91 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  29.69 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  36.36 
 
 
462 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  27.33 
 
 
492 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  31.91 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  29.22 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  32.03 
 
 
452 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  32.03 
 
 
452 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  32.03 
 
 
452 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  34.96 
 
 
449 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  29.33 
 
 
453 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  28.48 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  36.13 
 
 
456 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  36.26 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  29.29 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  29.07 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>