40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0789 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 180 aa  350  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  48.28 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  47.83 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  49.22 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  37.67 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  39.04 
 
 		 155 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  39.57 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  41.01 
 
 		 151 aa  84.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  32.89 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  35.92 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  33.66 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  35.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  38.3 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  32.77 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  34.15 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  41.18 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  37.62 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  28.92 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  32.56 
 
 		 462 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  30.83 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  36.26 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 501 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  29.36 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  29.36 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  32.26 
 
 		 492 aa  47.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  26.47 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  34.25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  35.37 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  30.12 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  38 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  22.32 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  26.57 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  32.47 
 
 		 155 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  26.17 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>