44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1147 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  54.25 
 
 
154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  56.58 
 
 
157 aa  175  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  51.02 
 
 
158 aa  165  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  41.26 
 
 
167 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  35.95 
 
 
156 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  40.52 
 
 
154 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  34.91 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  43.97 
 
 
123 aa  104  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  34.19 
 
 
155 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  38 
 
 
158 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  36.96 
 
 
156 aa  91.3  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 
501 aa  88.6  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
151 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  39.46 
 
 
166 aa  84  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  39.85 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  37.88 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  33.92 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  37.5 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  34.65 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  36.55 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  33.59 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  33.8 
 
 
492 aa  65.1  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  31.73 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  33.83 
 
 
167 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  33.65 
 
 
209 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  32.5 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  32.1 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  39.73 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  31.78 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  31.47 
 
 
159 aa  54.3  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  29.08 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  25.74 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  31.2 
 
 
462 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  34.25 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  30.65 
 
 
456 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  30.95 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>