39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1447 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  100 
 
 
165 aa  330  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  62.13 
 
 
176 aa  202  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  56.97 
 
 
159 aa  189  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  55.88 
 
 
165 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  52.66 
 
 
163 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  32.14 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  29.94 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
501 aa  67.8  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  29.7 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  34.67 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  31.95 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  27.95 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  35.56 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  30.43 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  30.46 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  31.1 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  28.85 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  27.33 
 
 
492 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  27.71 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  29.49 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  28.47 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  29.33 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  27.66 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  28.22 
 
 
158 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  32.23 
 
 
456 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.19 
 
 
532 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  30.95 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  28.57 
 
 
462 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  26.47 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  35.63 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11471  hypothetical protein  28.21 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.361197  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  24.84 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  27.15 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>