48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0588 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  60.12 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  53.89 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  52.66 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  51.5 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  38.18 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  31.21 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  29.7 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  31.65 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  30.49 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  33.75 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  33.12 
 
 		 492 aa  64.7  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  27.67 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  33.54 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  35.58 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  26.99 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  30.72 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  26.35 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  32.1 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  27.95 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  30.41 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  27.7 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  31.45 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  28.21 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  31.93 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  30.28 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  27.82 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 501 aa  54.7  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  42.03 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  48 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  27.97 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  34.11 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  26.06 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  36.76 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  38 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  25.37 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  44.26 
 
 		 532 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  27.22 
 
 		 449 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  45.07 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2867  hypothetical protein  40.32 
 
 		 154 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  29.45 
 
 		 453 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>