43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3114 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  71.72 
 
 		 166 aa  211  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  54.23 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  54.33 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  45.24 
 
 		 155 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  48.89 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  41.27 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  36.51 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  39.56 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  38.46 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  37.04 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  38.3 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  35.58 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  36.27 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.23 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  32.99 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  39.24 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  42 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  33.65 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  36.25 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  36.9 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  34.86 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  33.68 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  30.38 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  34.02 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  32.5 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  30.95 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  33.7 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  36.59 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  30.38 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  48 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  37.97 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  38.81 
 
 		 456 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  34.15 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  35.63 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  32.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>