51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2300 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  100 
 
 
153 aa  308  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  54 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  51.45 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  57.26 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
501 aa  133  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  51.03 
 
 
166 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  39.26 
 
 
152 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  42.03 
 
 
158 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  38.26 
 
 
156 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  40.43 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  38.46 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  39.23 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  37.78 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  36.3 
 
 
167 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  38.16 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  37.32 
 
 
153 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  39.13 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  41.03 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  32.52 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  29.94 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  40.22 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  32.85 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  37.04 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  31.65 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  30.66 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  33.1 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  28.68 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  35.71 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  34 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  30.46 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  29.2 
 
 
492 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  34.41 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  29.52 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  27.61 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  34.25 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  24.81 
 
 
148 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  29.91 
 
 
456 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  22.69 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  28 
 
 
448 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  28.8 
 
 
489 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>