52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2511 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  52 
 
 
149 aa  174  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  52.63 
 
 
155 aa  170  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  52.32 
 
 
151 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  51.66 
 
 
151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  54.67 
 
 
147 aa  163  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  47.33 
 
 
149 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  39.01 
 
 
462 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 
501 aa  91.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  36.88 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  32.56 
 
 
492 aa  85.1  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  40.6 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  35.29 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  38.18 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  39.69 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  35.97 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  31.93 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  34.35 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  30.82 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  27.4 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  30.41 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  31.25 
 
 
449 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  33.83 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  30.1 
 
 
123 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  29.17 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  28.76 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.47 
 
 
532 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  29.69 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  27.56 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  30.82 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  30.38 
 
 
453 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  27.49 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  27.82 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  28.28 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1736  hypothetical protein  30.13 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39702  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  28.19 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  28.12 
 
 
452 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  28.12 
 
 
452 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  25.62 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  31.97 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  28.12 
 
 
452 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  25.37 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  30.23 
 
 
456 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  32.81 
 
 
448 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  30.93 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  24.31 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  32.91 
 
 
209 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11471  hypothetical protein  24.66 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.361197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>