45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0472 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  62.76 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  58.39 
 
 		 153 aa  179  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  58.78 
 
 		 156 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  51.66 
 
 		 151 aa  163  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  43.51 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  45.1 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  42.11 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  43.36 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  41.38 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  43.24 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  38.62 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  40.52 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 501 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  43.15 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  36.36 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  39.07 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  37.78 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  40.74 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  37.16 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  32.65 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  32.65 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  29.41 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  30.14 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  28.48 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  29.86 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  29.87 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  30.43 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  30.82 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  36.45 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  28.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  36.59 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  27.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  29.55 
 
 		 456 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  36.11 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  34.62 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  38.75 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  32.93 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  20.8 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>