33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0598 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  328  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  46.62 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  41.33 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  36.51 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  36.62 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  35.1 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  36.29 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  32.17 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  35.56 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  35.8 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  23.81 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  29.11 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  29.07 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  27.85 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  28.19 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  32 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  26.71 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  28.21 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  29.76 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  29.27 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  31.88 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  24.66 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  24.52 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  21.62 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  23.87 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  29.07 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 501 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>