49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3513 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  311  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  66.67 
 
 
155 aa  224  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  60.54 
 
 
147 aa  201  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  60.27 
 
 
151 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  59.59 
 
 
151 aa  193  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 
149 aa  191  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  52 
 
 
167 aa  174  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  37.59 
 
 
462 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  35 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  32.14 
 
 
492 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  28.47 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
501 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  30 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  33.59 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  30.23 
 
 
449 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  32.35 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04550  cyclase/dehydrase ; Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.68 
 
 
532 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  31.93 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  29.41 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  28.68 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  30.71 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  31.93 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  30.14 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  27.22 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  31.95 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  29.46 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  28.46 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  30.72 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  27.91 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  27.14 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  29.85 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  24.64 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2999  hypothetical protein  27.13 
 
 
453 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452618  normal  0.264746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  27.11 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3245  hypothetical protein  26.36 
 
 
452 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3307  hypothetical protein  26.36 
 
 
452 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559259  decreased coverage  0.00925428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3256  hypothetical protein  26.36 
 
 
452 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53881  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  27.78 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  31.76 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  28.44 
 
 
456 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  27.35 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1736  hypothetical protein  26.11 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39702  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3582  domain of unknown function DUF1731  27.56 
 
 
448 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  24.66 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>