47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1229 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  72.08 
 
 		 157 aa  240  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  54.25 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  50.66 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  41.96 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  53.45 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  42 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  38.16 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  36.6 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  34.67 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  39.58 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  38.62 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 501 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  34.62 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  36.49 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  34.46 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  33.59 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  36.03 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  33.59 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  33.86 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  32.35 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  31.16 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  38.3 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  31.16 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  29.69 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  29.17 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  27.4 
 
 		 462 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  28.08 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  27.39 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  25.36 
 
 		 492 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  28.74 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  22.06 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  26.67 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  22.52 
 
 		 456 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  29.49 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>