32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2500 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  322  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  55.7 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  46.62 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  42.55 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  45.24 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  38.97 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  41.78 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  27.22 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  33.7 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 501 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  25.62 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  22.76 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  31.63 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  26.5 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  34.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  27.91 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  29.81 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  36.76 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  23.03 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  31.34 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  22.37 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  30.26 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  23.53 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  27.85 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  22.68 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  29.49 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>