52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1083 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  56.29 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12053  hypothetical protein  59.31 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.101987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  51.66 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0897  hypothetical protein  49.66 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1650  hypothetical protein  51.08 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0999  cyclase/dehydrase  45.33 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2243  hypothetical protein  48.28 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000411573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0060  hypothetical protein  44.14 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1340  hypothetical protein  45.83 
 
 		 167 aa  136  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.326577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1302  hypothetical protein  41.61 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.895293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1385  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000011932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2090  hypothetical protein  41.22 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132231  normal  0.0392216 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1229  cyclase/dehydrase  41.89 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1147  hypothetical protein  41.43 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1109  cyclase/dehydrase  43.97 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1520  hypothetical protein  40.78 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00079382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2300  cell division inhibitor SulA  39.23 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.77 
 
 		 501 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0807  cyclase/dehydrase  35.97 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0375009  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3231  cyclase/dehydrase  37.04 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31785  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2406  cell division inhibitor SulA  33.09 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0951  hypothetical protein  35.96 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3513  hypothetical protein  30.71 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0961  domain of unknown function DUF1731  31.16 
 
 		 492 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4077  hypothetical protein  37.65 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.971123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1518  cyclase/dehydrase  29.23 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00883891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0603  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0618  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0584  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4393  cyclase/dehydrase  27.61 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101283 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3113  cyclase/dehydrase  31.97 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2813  hypothetical protein  30.95 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3114  hypothetical protein  30.38 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  27.2 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0588  cyclase/dehydrase  27.82 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2511  hypothetical protein  27.82 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0598  hypothetical protein  29.07 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.733654  normal  0.54782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2355  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3582  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0298255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2500  hypothetical protein  26.5 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4680  cyclase/dehydrase  32.05 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.989777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3771  hypothetical protein  26.37 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3727  hypothetical protein  23.77 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1558  hypothetical protein  22.54 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0789  cyclase/dehydrase  26.17 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.699515  normal  0.0299825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28520  conserved hypothetical protein TIGR01777  25.96 
 
 		 456 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.395924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3512  hypothetical protein  23.49 
 
 		 449 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.568836  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1447  cyclase/dehydrase  27.15 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0188  hypothetical protein  24.14 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.478226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  26.61 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4801  Polyketide cyclase/dehydrase  23.4 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>