19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0158 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  28.77 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  31.75 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  29.41 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  29.2 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  30.2 
 
 
156 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2368  hypothetical protein  24.26 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  25.22 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  30.07 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5278  Polyketide cyclase/dehydrase  27.73 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  29.52 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  29.52 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  25 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  27.72 
 
 
162 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
147 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  26.75 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1083  hypothetical protein  26.61 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.764092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  28.07 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0472  hypothetical protein  29.53 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>