36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2739 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  99.32 
 
 
153 aa  298  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  97.96 
 
 
153 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  73.43 
 
 
158 aa  217  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.06 
 
 
161 aa  151  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  35.86 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  42.06 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  40.18 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  40.19 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  31.29 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.73 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.58 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  38.61 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.65 
 
 
747 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  30.34 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  35.09 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  29.22 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  31.51 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  36.19 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.16 
 
 
246 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  27.59 
 
 
147 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  27.21 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  31.25 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  31.25 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  30.1 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1334  hypothetical protein  27.55 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00812663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  29.03 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  27.74 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  29.37 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1234  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.81 
 
 
141 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>