226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  100 
 
 
246 aa  489  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  52.48 
 
 
154 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  55.32 
 
 
154 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  54.61 
 
 
162 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  53.57 
 
 
145 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  48.23 
 
 
149 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  49.51 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.43 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.41 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  37.84 
 
 
171 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.96 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  34.31 
 
 
147 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.24 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.53 
 
 
92 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.07 
 
 
92 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0475  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.15 
 
 
88 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.12 
 
 
101 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.19 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.87 
 
 
101 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.12 
 
 
101 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.86 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1008  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.89 
 
 
76 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  41.35 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  36.19 
 
 
156 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.82 
 
 
97 aa  59.7  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
432 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.37 
 
 
89 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.25 
 
 
96 aa  58.9  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_004310  BR0082  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.79 
 
 
97 aa  58.9  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.406903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0080  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.79 
 
 
97 aa  58.9  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.58 
 
 
100 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.62 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.74 
 
 
103 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.35 
 
 
101 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.07 
 
 
94 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.73 
 
 
103 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0994809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5000  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.26 
 
 
78 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000718198  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  35.96 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  27.7 
 
 
152 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.84 
 
 
103 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.84 
 
 
96 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.25 
 
 
131 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0770  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.45 
 
 
95 aa  55.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  45.57 
 
 
101 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.78 
 
 
97 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.25 
 
 
120 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.79 
 
 
94 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.58 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.16 
 
 
91 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  37.5 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0248  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.31 
 
 
99 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.47 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2232  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.54 
 
 
77 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1825  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.64 
 
 
122 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.309531  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1320  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.88 
 
 
113 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197021  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0793  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.68 
 
 
98 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.03 
 
 
93 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5415  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.16 
 
 
107 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.236997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.06 
 
 
96 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3338  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 
137 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.19 
 
 
96 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 
105 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.07 
 
 
96 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.97 
 
 
96 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0741  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.5 
 
 
97 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.14 
 
 
106 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279515  normal  0.673491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.95 
 
 
97 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  32 
 
 
160 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  29.52 
 
 
155 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.35 
 
 
119 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.1 
 
 
94 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1698  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.14 
 
 
106 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  29.52 
 
 
155 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3071  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.89 
 
 
105 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  29.52 
 
 
155 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.62 
 
 
93 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3519  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.42 
 
 
115 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.777034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1683  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.32 
 
 
115 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3728  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.5 
 
 
101 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  28.79 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1692  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.33 
 
 
109 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  30.39 
 
 
164 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.56 
 
 
93 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0094  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.53 
 
 
96 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  28.79 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  28.79 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1419  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.9 
 
 
97 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0976  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 
111 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.37 
 
 
130 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0896385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.62 
 
 
93 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.97 
 
 
102 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2926  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.1 
 
 
101 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0207  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.37 
 
 
123 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0010  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.96 
 
 
96 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3384  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.37 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  28.95 
 
 
101 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1617  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.37 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4002  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.1 
 
 
101 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2985  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.37 
 
 
130 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>