More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1906 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  100 
 
 
218 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  56.34 
 
 
231 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  50.74 
 
 
225 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  49 
 
 
217 aa  177  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.01 
 
 
219 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  49.72 
 
 
235 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.66 
 
 
235 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.89 
 
 
224 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  42.65 
 
 
232 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  50.56 
 
 
236 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  46.46 
 
 
449 aa  148  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  42.42 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.72 
 
 
211 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  35.21 
 
 
223 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.47 
 
 
256 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  32.17 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  34.5 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  48.67 
 
 
417 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.56 
 
 
224 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  35.38 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  60 
 
 
99 aa  88.6  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.51 
 
 
103 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0727  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.01 
 
 
101 aa  81.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.856744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.56 
 
 
103 aa  79  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  40.91 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.63 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.7 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.1 
 
 
101 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.36 
 
 
91 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.84 
 
 
93 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1320  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.18 
 
 
113 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197021  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.65 
 
 
96 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  35.65 
 
 
116 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04911  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  32.91 
 
 
96 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.449188  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.27 
 
 
97 aa  62  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2809  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.9 
 
 
101 aa  62  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.891802 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0793  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.14 
 
 
98 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.94 
 
 
96 aa  61.6  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.62 
 
 
97 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3629  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.89 
 
 
101 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.9 
 
 
100 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0673  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.25 
 
 
96 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252201  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.65 
 
 
101 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.99 
 
 
99 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.91 
 
 
105 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.14 
 
 
125 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.77 
 
 
96 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35 
 
 
96 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.29 
 
 
92 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1646  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.04 
 
 
116 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0328743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.18 
 
 
94 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1683  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.76 
 
 
115 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  31.3 
 
 
119 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05481  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (PCD)  32 
 
 
101 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.713347  normal  0.538116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0180  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.47 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.72 
 
 
94 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.43 
 
 
93 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.1 
 
 
92 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0770  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.97 
 
 
95 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.43 
 
 
102 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2674  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 
116 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0134  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.84 
 
 
97 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.57 
 
 
103 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1824  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32 
 
 
101 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.749262  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1689  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.07 
 
 
104 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
136 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.12 
 
 
119 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.18 
 
 
99 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.86 
 
 
149 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  31.21 
 
 
146 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  31.85 
 
 
144 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.56 
 
 
96 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.5 
 
 
395 aa  55.1  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  34.55 
 
 
121 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  29.93 
 
 
151 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0438  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.82 
 
 
98 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  32.11 
 
 
113 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.55 
 
 
113 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.454113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.11 
 
 
96 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2045  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.06 
 
 
107 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0827962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.12 
 
 
94 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  32.86 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.58 
 
 
127 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.14 
 
 
101 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1805  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.4 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.696832  normal  0.809401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0254  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.81 
 
 
90 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.569153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4534  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.1 
 
 
126 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  34.55 
 
 
130 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4648  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.8 
 
 
96 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  46.43 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.95 
 
 
101 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2141  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.4 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.206758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.1 
 
 
96 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05471  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.97 
 
 
96 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.375908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05181  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.97 
 
 
96 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00643072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>