78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3428 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.82 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  43.06 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  46.15 
 
 		 449 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.42 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  40.64 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  42.72 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  45.88 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  46.43 
 
 		 236 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  39.71 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.35 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.86 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  41.89 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.82 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.95 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.63 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  38.18 
 
 		 417 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.86 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  30.74 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.55 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  31.45 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  32.8 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  31.5 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 		 121 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  38.64 
 
 		 99 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  30.99 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  35.85 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  37.38 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  37.38 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  28.37 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  37.38 
 
 		 116 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 		 129 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  33.94 
 
 		 125 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  31.3 
 
 		 136 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.78 
 
 		 121 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  29.46 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  28.44 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  34.57 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  29.73 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  28.08 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  34.86 
 
 		 117 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 335 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  33.04 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  36.76 
 
 		 124 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  27.97 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  29.46 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  37.66 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  32.11 
 
 		 125 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  36.9 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.67 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  33.04 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  23.19 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.67 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  26.71 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  36.76 
 
 		 124 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  34.58 
 
 		 116 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  30.84 
 
 		 127 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  42  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 		 126 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  33.67 
 
 		 132 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>