116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2260 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  77.78 
 
 		 144 aa  238  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  73.61 
 
 		 144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  70.83 
 
 		 129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  64.83 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  62.5 
 
 		 127 aa  176  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  62.5 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  60.14 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  58.78 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  57.05 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  54.3 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  53.64 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  51.39 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  67.33 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  45.64 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  42.28 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  42.45 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  40.41 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  42.65 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  36.91 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  39.19 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  38.85 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  41.3 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  39.73 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  35.48 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  38.19 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  36.18 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  42.36 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  36.18 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  32.86 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  34.51 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  35.97 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  32.59 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  36.03 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  30.82 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  36.24 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  35.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  32.62 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  34.75 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  32.86 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  34.56 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  33.81 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  30.71 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  36.57 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  30.66 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 		 335 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  28.87 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  35.04 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  32.68 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  35.97 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  32.67 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  34.36 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.47 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.81 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  30.99 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  33.82 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.64 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  32.86 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  29.5 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.53 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.21 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.65 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  28.78 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  29.8 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  34.31 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.21 
 
 		 395 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  35.29 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.65 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.93 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  31.76 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  32.17 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  35.97 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1814  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.71 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  28.87 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  34.06 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>