138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  246  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  82.2 
 
 
119 aa  205  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  49.59 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  110  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  46.22 
 
 
131 aa  106  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  46.49 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  42.37 
 
 
150 aa  95.9  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  43.22 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  45.38 
 
 
127 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  42.74 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  40.94 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  40.87 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  40.16 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  40.17 
 
 
245 aa  83.6  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  42.15 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  38.66 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  42.15 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  42.15 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  40.34 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  38.66 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  42.86 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  38.21 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  39.5 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  38.46 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.29 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  38.6 
 
 
228 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  38.64 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  35.61 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  51.43 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  49.38 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  36.75 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  33.79 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.02 
 
 
395 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  33.88 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  35.96 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  33.88 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  33.88 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  33.1 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.29 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  33.81 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
238 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  35.46 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  34.75 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  31.43 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  35.04 
 
 
242 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.25 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  29.93 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  30.71 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.62 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  33.61 
 
 
241 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  32.68 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  32.79 
 
 
240 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  31.43 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  31.91 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  32.77 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  36.76 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.05 
 
 
234 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  31.62 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  32.09 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  32.45 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  32.37 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  33.06 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  30.97 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  31.45 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.33 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  31.29 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  45.59 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  30.43 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  30.26 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  35 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  34.19 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  27.56 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  27.82 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.57 
 
 
218 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  32.8 
 
 
130 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  34.19 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
121 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  44.12 
 
 
151 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>