155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1188 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
121 aa  244  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  49.09 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  42.59 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  43.12 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  41.07 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  44.04 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  39.45 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  43.24 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  40 
 
 
335 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  41.23 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  39.45 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  39.45 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  39.45 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.4 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  39.09 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.19 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  42.73 
 
 
117 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  37.07 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.94 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  35.42 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.7 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.7 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.7 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  37.82 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  45.65 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.21 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  51.52 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.04 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.47 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  38.33 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.56 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  41.23 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  33.83 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  34.78 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  40.35 
 
 
240 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.35 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  36.92 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  36.36 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  38.26 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  35.45 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  37.23 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  40.54 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  42.73 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  37.38 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  40.34 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.72 
 
 
395 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  37.04 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.32 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  35.54 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  32.88 
 
 
153 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  38.52 
 
 
239 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  38.53 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  33.1 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  34.29 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.69 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  38.74 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  36.11 
 
 
235 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.61 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  35.54 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  37.84 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.19 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  34.48 
 
 
236 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  45.57 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  35.07 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  38.18 
 
 
228 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  40.45 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  34.43 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  37.21 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  33.62 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.19 
 
 
218 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  33.63 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  35.4 
 
 
245 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  34.21 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  42.05 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.26 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  30.88 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  34.82 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  33.58 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  40.18 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  35.19 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  30.92 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  33.82 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  31.16 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  50.91 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1944  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
148 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  44.12 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>