112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  68.53 
 
 		 141 aa  199  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  64.34 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  64.38 
 
 		 146 aa  189  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  67.13 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  61.64 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  59.72 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  38.56 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  36.18 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  37.75 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  40.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  35.9 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  40.25 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  37.58 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  37.76 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  37.76 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  37.76 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  36.13 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  36.42 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  35.51 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  34.72 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  33.81 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  37.14 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  33.57 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  34.97 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  37.24 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  36.91 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  36.05 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  38 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  38 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  34.42 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  36.81 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  34.06 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  35.15 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  30.94 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  35.67 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  32.85 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  37.18 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  33.81 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  33.09 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  33.81 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  34.27 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  53.85 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  32.19 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  48.1 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  34.75 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  34.75 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  30.92 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  31.51 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  32.08 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  32.03 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  34.25 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  32.37 
 
 		 245 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  32.86 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  34.06 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.88 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  30.56 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  33.79 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  29.53 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  33.57 
 
 		 253 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.37 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.62 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.12 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  49.25 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.68 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 335 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  29.41 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  44.26 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  46.88 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  46.25 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  45.71 
 
 		 218 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.02 
 
 		 231 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  32.39 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3562  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00833026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  30.94 
 
 		 245 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3635  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276283  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  42.68 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  37.33 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>