262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0799 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
395 aa  768    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.02 
 
 
288 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.02 
 
 
297 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.75 
 
 
553 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.6 
 
 
550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.78 
 
 
357 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.51 
 
 
326 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.2 
 
 
471 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.27 
 
 
275 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  30.65 
 
 
375 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.64 
 
 
472 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.2 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  29.12 
 
 
400 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  29.12 
 
 
379 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.32 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.39 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.07 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  28.74 
 
 
401 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.56 
 
 
321 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.58 
 
 
309 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  32.95 
 
 
283 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  32.68 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  31.15 
 
 
359 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.92 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  28.19 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  31 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  28.73 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  30.5 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  30.5 
 
 
236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.46 
 
 
279 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  31.15 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  30 
 
 
236 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  29 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  30.5 
 
 
236 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.69 
 
 
330 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  30.5 
 
 
236 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.69 
 
 
333 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.75 
 
 
303 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  30.5 
 
 
236 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  31.8 
 
 
365 aa  112  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.46 
 
 
347 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  29.26 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  30.73 
 
 
236 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.77 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.77 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.38 
 
 
248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.5 
 
 
236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.35 
 
 
248 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.08 
 
 
304 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.21 
 
 
410 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.94 
 
 
408 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.19 
 
 
304 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.41 
 
 
365 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.64 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.07 
 
 
329 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.2 
 
 
258 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.62 
 
 
298 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.46 
 
 
416 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 
250 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.28 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  25.54 
 
 
250 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  30.86 
 
 
275 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  26.83 
 
 
251 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  26.83 
 
 
251 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  26.83 
 
 
251 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  26.83 
 
 
251 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  26.92 
 
 
251 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  26.34 
 
 
251 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  26.44 
 
 
251 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  24.68 
 
 
251 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.79 
 
 
520 aa  86.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.17 
 
 
230 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.12 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  41.28 
 
 
121 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  34.4 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  30.04 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  38.33 
 
 
119 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  37.61 
 
 
127 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  31.4 
 
 
259 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  36.44 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  38.74 
 
 
113 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.52 
 
 
244 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  35.42 
 
 
149 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  34.03 
 
 
145 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.11 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.78 
 
 
233 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  37.29 
 
 
130 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
335 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  36.94 
 
 
117 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.64 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.87 
 
 
127 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  35.34 
 
 
127 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  33.01 
 
 
255 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.96 
 
 
515 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.72 
 
 
121 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.78 
 
 
113 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>