185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1378 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
418 aa  866    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  51.69 
 
 
443 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  49.48 
 
 
359 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  39.37 
 
 
337 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  39.37 
 
 
337 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  46.71 
 
 
368 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  47.06 
 
 
365 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  44.29 
 
 
375 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  42.57 
 
 
379 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  46.92 
 
 
416 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  42.66 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  37.66 
 
 
401 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  42.35 
 
 
534 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.58 
 
 
297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.3 
 
 
309 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.6 
 
 
472 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.58 
 
 
357 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.51 
 
 
471 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.49 
 
 
288 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.85 
 
 
553 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.06 
 
 
520 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.96 
 
 
347 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.72 
 
 
550 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.7 
 
 
333 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.7 
 
 
330 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.73 
 
 
329 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.94 
 
 
275 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.21 
 
 
277 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.41 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.54 
 
 
274 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.91 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.12 
 
 
303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.24 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.08 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.15 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.69 
 
 
321 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.29 
 
 
298 aa  123  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.29 
 
 
298 aa  123  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.25 
 
 
298 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.11 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.84 
 
 
248 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.47 
 
 
410 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  28.74 
 
 
283 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.29 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.08 
 
 
248 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.51 
 
 
326 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  27.68 
 
 
275 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.32 
 
 
395 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.03 
 
 
408 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  30.09 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  30.09 
 
 
251 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  30.09 
 
 
251 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  30.09 
 
 
251 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  29.17 
 
 
251 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.35 
 
 
250 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.95 
 
 
250 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  26.48 
 
 
250 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  29.63 
 
 
251 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  27.56 
 
 
251 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  28.7 
 
 
251 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  28.11 
 
 
236 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.04 
 
 
247 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.25 
 
 
247 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  27.65 
 
 
236 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  27.19 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  27.19 
 
 
236 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.05 
 
 
248 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  27.19 
 
 
236 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  27.19 
 
 
236 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.65 
 
 
236 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  26.73 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.79 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  26.8 
 
 
255 aa  84  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  26.27 
 
 
236 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.77 
 
 
120 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.24 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.05 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  26.56 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.06 
 
 
122 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.48 
 
 
121 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.06 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.67 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.67 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.67 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6101  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.91 
 
 
153 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32194  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  31.19 
 
 
127 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.8 
 
 
126 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.52 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.51 
 
 
127 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.51 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.54 
 
 
159 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.09 
 
 
157 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.58 
 
 
127 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.89 
 
 
258 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.23 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  27.05 
 
 
123 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0081  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.71 
 
 
250 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.53662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.48 
 
 
134 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>