169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0474 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2778  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  77.15 
 
 
298 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.0351721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  66.15 
 
 
309 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  63.14 
 
 
321 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  67.9 
 
 
283 aa  332  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3738  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  57.52 
 
 
304 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  53.82 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  60.71 
 
 
279 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  61.73 
 
 
274 aa  301  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.11 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.85 
 
 
297 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.23 
 
 
347 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.34 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.63 
 
 
550 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.06 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  29.12 
 
 
359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.91 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.85 
 
 
471 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  29.82 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  30.07 
 
 
368 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  28.57 
 
 
443 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  27.53 
 
 
400 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.15 
 
 
365 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.6 
 
 
553 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.29 
 
 
418 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.39 
 
 
416 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.82 
 
 
288 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  27.13 
 
 
379 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.53 
 
 
329 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.76 
 
 
330 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.76 
 
 
333 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  27.13 
 
 
401 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.93 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.08 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  26.95 
 
 
349 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.82 
 
 
410 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  30.71 
 
 
534 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  26.56 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.5 
 
 
408 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.29 
 
 
410 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  24.34 
 
 
337 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  26.52 
 
 
250 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  24.01 
 
 
337 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  26.29 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 
309 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  25.88 
 
 
251 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  25.88 
 
 
251 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.29 
 
 
250 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  26.67 
 
 
251 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  26.67 
 
 
251 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.2 
 
 
326 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  26.27 
 
 
251 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  26.27 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.01 
 
 
520 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  25.49 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  27.61 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.09 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.77 
 
 
395 aa  95.9  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.31 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2338  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2287  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.92 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.6 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.17 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3112  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.96 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.9 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  29.34 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  23.9 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.91 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.9 
 
 
236 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  23.9 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  28.98 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  24.04 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3493  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.59 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  23.41 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.92 
 
 
127 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  23.41 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.91 
 
 
140 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.41 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  22.58 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.8 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  28.05 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.54 
 
 
159 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.57 
 
 
127 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2921  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.59 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.03619  normal  0.0371299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.66 
 
 
120 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  35.29 
 
 
127 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.84 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.43 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.05 
 
 
127 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.83 
 
 
127 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.5 
 
 
127 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.88 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 
123 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.67 
 
 
127 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28 
 
 
121 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  33.96 
 
 
127 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>