More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03744 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  100 
 
 		 534 aa  1078    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  61.64 
 
 		 520 aa  605  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  46.37 
 
 		 443 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  47.54 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  42.67 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.21 
 
 		 309 aa  243  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  45.77 
 
 		 365 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  47.02 
 
 		 359 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  41.11 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  39.8 
 
 		 375 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  40.77 
 
 		 379 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  40.77 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  40.86 
 
 		 337 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  40.97 
 
 		 337 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.17 
 
 		 297 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.92 
 
 		 416 aa  211  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.46 
 
 		 553 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.35 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.04 
 
 		 471 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.08 
 
 		 330 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.08 
 
 		 333 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.81 
 
 		 347 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.4 
 
 		 550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4496  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.26 
 
 		 329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.79 
 
 		 472 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.87 
 
 		 357 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.93 
 
 		 288 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.5 
 
 		 275 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.98 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.85 
 
 		 277 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.65 
 
 		 465 aa  173  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  48.79 
 
 		 213 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.89 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  49.04 
 
 		 214 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.93 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.72 
 
 		 326 aa  161  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.63 
 
 		 213 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.54 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.71 
 
 		 214 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.23 
 
 		 216 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  45.54 
 
 		 214 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.31 
 
 		 207 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  39.71 
 
 		 207 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.59 
 
 		 224 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  47.64 
 
 		 211 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.77 
 
 		 304 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  36.54 
 
 		 207 aa  137  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  40.5 
 
 		 468 aa  136  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.45 
 
 		 309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.06 
 
 		 212 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 215 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  40.38 
 
 		 218 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.48 
 
 		 274 aa  134  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.25 
 
 		 214 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  37.88 
 
 		 209 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  37.88 
 
 		 209 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.84 
 
 		 205 aa  131  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2299  CbiX protein  32.57 
 
 		 283 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.66626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.02 
 
 		 248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.35 
 
 		 207 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  41.71 
 
 		 239 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.04 
 
 		 215 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.82 
 
 		 211 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  36.19 
 
 		 211 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.89 
 
 		 228 aa  127  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  36.5 
 
 		 211 aa  127  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  37.37 
 
 		 224 aa  127  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.4 
 
 		 226 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.15 
 
 		 213 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  42.5 
 
 		 221 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  38.19 
 
 		 225 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.93 
 
 		 222 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  36.87 
 
 		 225 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.7 
 
 		 321 aa  125  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.12 
 
 		 213 aa  123  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  36.84 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.55 
 
 		 209 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0474  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.71 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0439  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.71 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  36.19 
 
 		 220 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  42.25 
 
 		 199 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.56 
 
 		 219 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.14 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  33.66 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  39.18 
 
 		 249 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  36.26 
 
 		 210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  30.4 
 
 		 275 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.76 
 
 		 222 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3135  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.45 
 
 		 279 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.05 
 
 		 248 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  28.4 
 
 		 251 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  38.38 
 
 		 219 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  28 
 
 		 251 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.89 
 
 		 229 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  40.84 
 
 		 208 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  28 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  33.17 
 
 		 200 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  37.43 
 
 		 210 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  37.19 
 
 		 220 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>