More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4475 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
451 aa  938    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.21 
 
 
469 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.32 
 
 
472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  49.45 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.77 
 
 
778 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.36 
 
 
623 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.36 
 
 
623 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.1 
 
 
800 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.74 
 
 
258 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.47 
 
 
810 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  46.91 
 
 
594 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  45 
 
 
837 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.12 
 
 
629 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  45.71 
 
 
663 aa  216  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  46.72 
 
 
326 aa  216  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  45.08 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  45.68 
 
 
287 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  45.49 
 
 
593 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.54 
 
 
631 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  45.49 
 
 
593 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  43.03 
 
 
423 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  44.13 
 
 
241 aa  210  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  46.5 
 
 
579 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.55 
 
 
328 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.09 
 
 
241 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.83 
 
 
241 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.83 
 
 
241 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.49 
 
 
537 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  44.26 
 
 
329 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  44.26 
 
 
329 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.68 
 
 
241 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.53 
 
 
481 aa  206  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.27 
 
 
241 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.13 
 
 
327 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.32 
 
 
520 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  41.49 
 
 
561 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.67 
 
 
596 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.66 
 
 
329 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.67 
 
 
331 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.15 
 
 
263 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.1 
 
 
240 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.4 
 
 
240 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  44.22 
 
 
772 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.15 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  42.62 
 
 
458 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  40.55 
 
 
574 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.39 
 
 
604 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.43 
 
 
776 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.15 
 
 
284 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  41.67 
 
 
238 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.96 
 
 
236 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.55 
 
 
264 aa  192  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.98 
 
 
547 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  42.39 
 
 
620 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  41.04 
 
 
777 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  42.45 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  42.45 
 
 
495 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  42.45 
 
 
495 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.08 
 
 
240 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.98 
 
 
240 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.21 
 
 
612 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.08 
 
 
240 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.31 
 
 
797 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.66 
 
 
243 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  40.61 
 
 
567 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  44.44 
 
 
655 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.08 
 
 
567 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.3 
 
 
435 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.23 
 
 
495 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  42.34 
 
 
566 aa  187  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.91 
 
 
242 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.06 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.9 
 
 
577 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.75 
 
 
600 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.99 
 
 
495 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  42 
 
 
257 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.2 
 
 
563 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.46 
 
 
236 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.17 
 
 
253 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  42.19 
 
 
258 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  41.77 
 
 
551 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.46 
 
 
259 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  38.62 
 
 
606 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.91 
 
 
565 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  40.23 
 
 
567 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.09 
 
 
600 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  40 
 
 
867 aa  176  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.75 
 
 
560 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.23 
 
 
611 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.49 
 
 
253 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.67 
 
 
572 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.17 
 
 
560 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.68 
 
 
516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.9 
 
 
787 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  41.98 
 
 
509 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 
253 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.85 
 
 
574 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2892  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  39.75 
 
 
507 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.45 
 
 
250 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>