More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0216 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
284 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  70.16 
 
 
263 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  65.86 
 
 
655 aa  322  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.9 
 
 
253 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.05 
 
 
250 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.62 
 
 
810 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.69 
 
 
253 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.15 
 
 
240 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  46.47 
 
 
241 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.53 
 
 
243 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.96 
 
 
241 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
241 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
241 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.82 
 
 
596 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.6 
 
 
867 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  46.56 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.35 
 
 
800 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.28 
 
 
244 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.59 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  49.41 
 
 
772 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  47.62 
 
 
777 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  43.98 
 
 
238 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 
520 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.87 
 
 
240 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  52.42 
 
 
797 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  52.3 
 
 
241 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.64 
 
 
242 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.9 
 
 
469 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.62 
 
 
778 aa  208  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  49.01 
 
 
776 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.75 
 
 
837 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.41 
 
 
435 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  44.49 
 
 
329 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  44.49 
 
 
329 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 
468 aa  205  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  46.15 
 
 
423 aa  205  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.98 
 
 
472 aa  205  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.91 
 
 
264 aa  202  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.56 
 
 
240 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.56 
 
 
240 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.53 
 
 
631 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.91 
 
 
629 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  44.94 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.87 
 
 
328 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  44.94 
 
 
326 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.87 
 
 
577 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  44.49 
 
 
458 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  47.76 
 
 
579 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.21 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  44.86 
 
 
663 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.56 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  50.2 
 
 
561 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  44 
 
 
623 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  44 
 
 
623 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.85 
 
 
600 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.34 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.98 
 
 
240 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.97 
 
 
600 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.34 
 
 
331 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.74 
 
 
604 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.46 
 
 
574 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.67 
 
 
537 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.35 
 
 
594 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  40.5 
 
 
593 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  40.5 
 
 
593 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.3 
 
 
236 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 
787 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.97 
 
 
320 aa  185  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.96 
 
 
329 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  42.21 
 
 
606 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.41 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.36 
 
 
612 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.19 
 
 
222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  43.98 
 
 
519 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  42.74 
 
 
620 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.41 
 
 
345 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.58 
 
 
250 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 
547 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.52 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  45.45 
 
 
238 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  40.73 
 
 
574 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0512  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.03 
 
 
265 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.215708  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.86 
 
 
512 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5689  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
256 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.69 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.62 
 
 
611 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.32 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  35.58 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.78 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  42.35 
 
 
567 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.96 
 
 
567 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  45.6 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.73 
 
 
572 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3213  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.13 
 
 
266 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1851  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.25 
 
 
220 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.65 
 
 
565 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.49 
 
 
245 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.06 
 
 
560 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>