More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0802 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
547 aa  1035    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.3 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  40.63 
 
 
561 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.16 
 
 
574 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.17 
 
 
778 aa  267  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.01 
 
 
800 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  33.69 
 
 
620 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  38.79 
 
 
655 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.73 
 
 
629 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.42 
 
 
611 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.68 
 
 
593 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.76 
 
 
623 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.45 
 
 
631 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.6 
 
 
623 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.97 
 
 
604 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  29.51 
 
 
593 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  36.9 
 
 
594 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  35.36 
 
 
579 aa  233  6e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  28.8 
 
 
606 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28.94 
 
 
600 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  28.97 
 
 
600 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  30.48 
 
 
663 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  33.59 
 
 
537 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.72 
 
 
612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.36 
 
 
958 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.12 
 
 
837 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.98 
 
 
451 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.39 
 
 
810 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.79 
 
 
263 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.66 
 
 
236 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 
284 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.23 
 
 
240 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  33.77 
 
 
867 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.71 
 
 
601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.23 
 
 
567 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  44.96 
 
 
241 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  44.35 
 
 
331 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.25 
 
 
258 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.1 
 
 
567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.96 
 
 
563 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.13 
 
 
596 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.98 
 
 
469 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 
241 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 
241 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.15 
 
 
520 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 
241 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  43.5 
 
 
329 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  43.5 
 
 
329 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.78 
 
 
242 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.82 
 
 
777 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.5 
 
 
472 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 
241 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.51 
 
 
240 aa  180  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.92 
 
 
241 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.38 
 
 
481 aa  179  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  46.61 
 
 
495 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  46.61 
 
 
495 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  46.22 
 
 
495 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  42.91 
 
 
458 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.35 
 
 
331 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  42.28 
 
 
423 aa  176  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.52 
 
 
240 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.52 
 
 
240 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.22 
 
 
772 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.75 
 
 
243 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.22 
 
 
776 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  38.27 
 
 
468 aa  174  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  38.98 
 
 
238 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  30.1 
 
 
566 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  41.87 
 
 
326 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  40.39 
 
 
287 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.98 
 
 
565 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  33.15 
 
 
567 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  45.3 
 
 
509 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.05 
 
 
329 aa  170  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.2 
 
 
560 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
264 aa  170  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.15 
 
 
516 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.89 
 
 
254 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  29.26 
 
 
574 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  39.84 
 
 
267 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.03 
 
 
577 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.43 
 
 
595 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.09 
 
 
327 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.91 
 
 
259 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.98 
 
 
257 aa  167  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.66 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.6 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  45.19 
 
 
238 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.34 
 
 
236 aa  166  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  42.91 
 
 
258 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.17 
 
 
240 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  47.95 
 
 
797 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.39 
 
 
250 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  52.28 
 
 
241 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
222 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.64 
 
 
560 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.9 
 
 
253 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0144  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.19 
 
 
464 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.856588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
320 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>