More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1571 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  58.38 
 
 
567 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  84.49 
 
 
568 aa  931    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  84.56 
 
 
579 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  67.33 
 
 
572 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2401  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  67.1 
 
 
603 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.346168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  93.45 
 
 
577 aa  1023    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  64.21 
 
 
604 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  83.67 
 
 
569 aa  924    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
595 aa  1151    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  83.67 
 
 
569 aa  924    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  67.9 
 
 
567 aa  685    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  59.33 
 
 
563 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  83.36 
 
 
571 aa  886    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  58.89 
 
 
567 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.36 
 
 
567 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1964  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  64.57 
 
 
609 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0059867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  58.4 
 
 
551 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.15 
 
 
565 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.32 
 
 
560 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.82 
 
 
560 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  61.53 
 
 
559 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2251  precorrin-3 methylase CobJ  61.02 
 
 
559 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.27 
 
 
572 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  53.55 
 
 
564 aa  535  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  53.38 
 
 
581 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  46.39 
 
 
574 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  41.95 
 
 
566 aa  435  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.58 
 
 
612 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1947  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  78.44 
 
 
616 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2110  precorrin-3b C17-methyltransferase  78.44 
 
 
619 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.571723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0893  precorrin-3B C17-methyltransferase  78.07 
 
 
616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0267  precorrin-3B C17-methyltransferase  78.07 
 
 
616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1605  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  78.07 
 
 
616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1164  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  78.07 
 
 
614 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0149118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.03 
 
 
601 aa  334  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  65.46 
 
 
258 aa  331  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 
481 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.15 
 
 
261 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.61 
 
 
257 aa  257  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1886  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.44 
 
 
253 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.25 
 
 
279 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0338  precorrin-3 methyltransferase  54.72 
 
 
262 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.04 
 
 
253 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.23 
 
 
253 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.82 
 
 
253 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5689  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.42 
 
 
256 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2824  precorrin-3 methyltransferase  57.09 
 
 
244 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.82 
 
 
254 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.66 
 
 
253 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1471  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.68 
 
 
244 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1521  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.68 
 
 
244 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1710  precorrin-3B C17-methyltransferase  54 
 
 
253 aa  236  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.0273239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2214  precorrin-3 methyltransferase  51.79 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2536  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.82 
 
 
242 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1435  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.21 
 
 
253 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  52.23 
 
 
255 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.21 
 
 
495 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.85 
 
 
495 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1432  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.4 
 
 
258 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.688222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.88 
 
 
490 aa  231  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  56.17 
 
 
509 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.53 
 
 
778 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  55.02 
 
 
526 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.01 
 
 
800 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  51.17 
 
 
495 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7177  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.42 
 
 
254 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  0.140897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.17 
 
 
492 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.8 
 
 
254 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  50.78 
 
 
495 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  50.78 
 
 
495 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 
259 aa  223  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.66 
 
 
258 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  51.92 
 
 
511 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2927  precorrin-3 methyltransferase  52.23 
 
 
250 aa  216  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  hitchhiker  0.0033865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.42 
 
 
867 aa  213  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2892  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  51.55 
 
 
507 aa  213  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.79 
 
 
516 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.51 
 
 
529 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  35.23 
 
 
561 aa  208  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  31.33 
 
 
620 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  31.64 
 
 
537 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0574  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.62 
 
 
523 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17670  precorrin-2 C20-methyltransferase  52.82 
 
 
510 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0155473  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2442  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.62 
 
 
283 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0456628  normal  0.0730106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3282  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.2 
 
 
282 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776129  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  34.32 
 
 
655 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.68 
 
 
623 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.33 
 
 
629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.2 
 
 
837 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.52 
 
 
623 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.09 
 
 
500 aa  199  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3409  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  48.79 
 
 
526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12102  bifunctional protein, cobI-cobJ fusion protein: S-adenosyl-L-methionine-precorrin-2 methyl transferase + precorrin-3 methylase  48.66 
 
 
508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274477  normal  0.708984 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.1 
 
 
594 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  33.51 
 
 
579 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5848  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.16 
 
 
277 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.528372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.36 
 
 
631 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  40.49 
 
 
241 aa  192  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.22 
 
 
469 aa  190  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.72 
 
 
241 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>