More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1521 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1521  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
244 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2824  precorrin-3 methyltransferase  95.08 
 
 
244 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1471  precorrin-3B C17-methyltransferase  94.67 
 
 
244 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2536  precorrin-3B C17-methyltransferase  84.71 
 
 
242 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0338  precorrin-3 methyltransferase  74.21 
 
 
262 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2927  precorrin-3 methyltransferase  74.49 
 
 
250 aa  351  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  hitchhiker  0.0033865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2214  precorrin-3 methyltransferase  73.17 
 
 
273 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5848  precorrin-3B C17-methyltransferase  69.05 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.528372  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1886  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.4 
 
 
253 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.8 
 
 
253 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.4 
 
 
253 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.5 
 
 
253 aa  291  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.24 
 
 
257 aa  275  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.57 
 
 
567 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  58.17 
 
 
567 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5689  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.43 
 
 
256 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.08 
 
 
253 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.26 
 
 
563 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.18 
 
 
565 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.45 
 
 
560 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.45 
 
 
560 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  58.47 
 
 
551 aa  254  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.57 
 
 
279 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  54.84 
 
 
255 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.44 
 
 
259 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.09 
 
 
577 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1710  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.68 
 
 
253 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.0273239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.68 
 
 
595 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1435  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.28 
 
 
253 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1432  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.68 
 
 
258 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.688222 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.26 
 
 
569 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.26 
 
 
569 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.87 
 
 
261 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  56.4 
 
 
258 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.09 
 
 
568 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.49 
 
 
571 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.25 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  54.44 
 
 
604 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  56.18 
 
 
567 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  57.09 
 
 
579 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.8 
 
 
481 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  54.66 
 
 
559 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  48.58 
 
 
574 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  54.98 
 
 
581 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  54.98 
 
 
564 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.73 
 
 
572 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.79 
 
 
572 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3282  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.06 
 
 
282 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776129  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7177  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.85 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  0.140897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.63 
 
 
567 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.86 
 
 
490 aa  218  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0574  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.67 
 
 
523 aa  218  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.78 
 
 
529 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  50 
 
 
566 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17670  precorrin-2 C20-methyltransferase  51.65 
 
 
510 aa  214  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0155473  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2251  precorrin-3 methylase CobJ  55.06 
 
 
559 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2110  precorrin-3b C17-methyltransferase  56.28 
 
 
619 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.571723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1947  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  56.28 
 
 
616 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1964  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  56.28 
 
 
609 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0059867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 
254 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0893  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.87 
 
 
616 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0267  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.87 
 
 
616 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2401  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  55.87 
 
 
603 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.346168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1605  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  55.87 
 
 
616 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1164  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  55.87 
 
 
614 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0149118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3409  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  49.37 
 
 
526 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.02 
 
 
500 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2442  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.68 
 
 
283 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0456628  normal  0.0730106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.14 
 
 
495 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.36 
 
 
513 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  45.71 
 
 
495 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2892  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  48.52 
 
 
507 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  45.31 
 
 
495 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  45.31 
 
 
495 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.72 
 
 
516 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.62 
 
 
495 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  48.91 
 
 
509 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  47.9 
 
 
511 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.51 
 
 
472 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.65 
 
 
492 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  46.94 
 
 
526 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.48 
 
 
258 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.8 
 
 
612 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.74 
 
 
867 aa  175  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.68 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.27 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.34 
 
 
631 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.68 
 
 
623 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  38.91 
 
 
241 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 
263 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.68 
 
 
623 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.37 
 
 
778 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  44 
 
 
837 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12102  bifunctional protein, cobI-cobJ fusion protein: S-adenosyl-L-methionine-precorrin-2 methyl transferase + precorrin-3 methylase  44.66 
 
 
508 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274477  normal  0.708984 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  41.08 
 
 
579 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.82 
 
 
800 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.19 
 
 
284 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.58 
 
 
244 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.93 
 
 
629 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  42.17 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>