More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2636 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
612 aa  1226    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.82 
 
 
601 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  46.81 
 
 
574 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  41.19 
 
 
566 aa  415  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  41.85 
 
 
581 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  42.02 
 
 
564 aa  411  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.1 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.88 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.89 
 
 
577 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.05 
 
 
595 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.19 
 
 
569 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.19 
 
 
569 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  41.93 
 
 
579 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.47 
 
 
565 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.17 
 
 
563 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  38.45 
 
 
567 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.51 
 
 
560 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.03 
 
 
571 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  38.19 
 
 
567 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.35 
 
 
567 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.93 
 
 
560 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  40.37 
 
 
559 aa  357  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  38.47 
 
 
551 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.78 
 
 
572 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.09 
 
 
567 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2251  precorrin-3 methylase CobJ  40.2 
 
 
559 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.08 
 
 
623 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.53 
 
 
537 aa  312  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.08 
 
 
623 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.96 
 
 
594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.82 
 
 
778 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  38.35 
 
 
620 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  40.62 
 
 
561 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  39.21 
 
 
579 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.86 
 
 
481 aa  301  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.21 
 
 
631 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.92 
 
 
800 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.97 
 
 
629 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.63 
 
 
593 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  33.27 
 
 
593 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.86 
 
 
258 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.46 
 
 
604 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.93 
 
 
611 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.73 
 
 
867 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.19 
 
 
600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.07 
 
 
600 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  30.89 
 
 
606 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.28 
 
 
837 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  33.12 
 
 
663 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.4 
 
 
577 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.87 
 
 
574 aa  246  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.6 
 
 
259 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  32.18 
 
 
655 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.99 
 
 
257 aa  225  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.02 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.56 
 
 
253 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  47.2 
 
 
258 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  45.98 
 
 
604 aa  213  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.72 
 
 
547 aa  213  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.84 
 
 
253 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.88 
 
 
253 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1886  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.35 
 
 
253 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.84 
 
 
469 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  34.05 
 
 
958 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.48 
 
 
261 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  45.17 
 
 
495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  43.78 
 
 
255 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  44.79 
 
 
495 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  44.79 
 
 
495 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.76 
 
 
279 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  45.6 
 
 
526 aa  197  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.72 
 
 
472 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0338  precorrin-3 methyltransferase  42.21 
 
 
262 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.87 
 
 
254 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.23 
 
 
492 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.25 
 
 
254 aa  190  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.21 
 
 
451 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  42.41 
 
 
458 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  42.57 
 
 
241 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  41.8 
 
 
331 aa  188  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.98 
 
 
241 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  41.86 
 
 
329 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  41.86 
 
 
329 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.58 
 
 
241 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.48 
 
 
777 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5689  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.77 
 
 
256 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.58 
 
 
241 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.58 
 
 
241 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.58 
 
 
241 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.3 
 
 
240 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.08 
 
 
520 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.38 
 
 
329 aa  184  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.08 
 
 
516 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.6 
 
 
244 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  43.75 
 
 
287 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.4 
 
 
264 aa  183  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  42.69 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.16 
 
 
253 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.08 
 
 
810 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.25 
 
 
263 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>