More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5372 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  64.49 
 
 
565 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.96 
 
 
560 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  73.33 
 
 
572 aa  769    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  63.25 
 
 
567 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
567 aa  1118    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  70.73 
 
 
568 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.83 
 
 
567 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  64.13 
 
 
567 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  69.74 
 
 
579 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.6 
 
 
563 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  85.19 
 
 
604 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  69.55 
 
 
577 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  70.72 
 
 
569 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  62.63 
 
 
551 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  67.11 
 
 
595 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  70.72 
 
 
569 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  69.01 
 
 
571 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.78 
 
 
560 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2401  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  63.91 
 
 
603 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.346168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  66.61 
 
 
559 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1964  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  61.64 
 
 
609 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0059867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2251  precorrin-3 methylase CobJ  66.43 
 
 
559 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1947  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  61.43 
 
 
616 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1164  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  61.3 
 
 
614 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0149118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  57.45 
 
 
564 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  57.27 
 
 
581 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.22 
 
 
572 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  47.2 
 
 
574 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  42.68 
 
 
566 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.09 
 
 
612 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  64.8 
 
 
258 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.31 
 
 
601 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2110  precorrin-3b C17-methyltransferase  71.43 
 
 
619 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.571723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0893  precorrin-3B C17-methyltransferase  71.43 
 
 
616 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1605  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  71.43 
 
 
616 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0267  precorrin-3B C17-methyltransferase  71.43 
 
 
616 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.45 
 
 
481 aa  271  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.23 
 
 
253 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.95 
 
 
261 aa  253  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5689  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.42 
 
 
256 aa  250  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.21 
 
 
253 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.82 
 
 
254 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1886  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.4 
 
 
253 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2536  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.02 
 
 
242 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  51 
 
 
253 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.18 
 
 
279 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.59 
 
 
257 aa  241  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0338  precorrin-3 methyltransferase  51.18 
 
 
262 aa  240  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2824  precorrin-3 methyltransferase  54.03 
 
 
244 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1471  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.03 
 
 
244 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  36.5 
 
 
561 aa  236  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7177  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.41 
 
 
254 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  0.140897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1521  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.63 
 
 
244 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.79 
 
 
253 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1710  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.2 
 
 
253 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.0273239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  49.42 
 
 
495 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  49.42 
 
 
495 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  49.03 
 
 
495 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.4 
 
 
495 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1435  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.6 
 
 
253 aa  228  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1432  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.6 
 
 
258 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.688222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.8 
 
 
254 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  48.8 
 
 
255 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.79 
 
 
778 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.2 
 
 
623 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2927  precorrin-3 methyltransferase  50 
 
 
250 aa  220  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  hitchhiker  0.0033865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2214  precorrin-3 methyltransferase  47.22 
 
 
273 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.79 
 
 
259 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.31 
 
 
258 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.59 
 
 
623 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3282  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.76 
 
 
282 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776129  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.44 
 
 
867 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.1 
 
 
495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.21 
 
 
492 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.1 
 
 
800 aa  211  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.72 
 
 
631 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.62 
 
 
516 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.5 
 
 
490 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  48.81 
 
 
526 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5848  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.19 
 
 
277 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.528372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  51.05 
 
 
509 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2442  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.73 
 
 
283 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0456628  normal  0.0730106 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  29.96 
 
 
537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.13 
 
 
253 aa  198  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0574  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.78 
 
 
523 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  31.36 
 
 
579 aa  194  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  32.85 
 
 
655 aa  193  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.03 
 
 
500 aa  193  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.8 
 
 
529 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.28 
 
 
837 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  46.56 
 
 
511 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12102  bifunctional protein, cobI-cobJ fusion protein: S-adenosyl-L-methionine-precorrin-2 methyl transferase + precorrin-3 methylase  45.04 
 
 
508 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274477  normal  0.708984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.44 
 
 
810 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  39.74 
 
 
241 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2892  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  46.46 
 
 
507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.19 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.1 
 
 
241 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.67 
 
 
241 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.67 
 
 
241 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.67 
 
 
241 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>