More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3181 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  100 
 
 
655 aa  1318    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.57 
 
 
778 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.7 
 
 
631 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.33 
 
 
837 aa  350  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  42.55 
 
 
561 aa  347  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.87 
 
 
623 aa  340  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.36 
 
 
800 aa  339  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.87 
 
 
623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  65.57 
 
 
284 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.13 
 
 
629 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  67.33 
 
 
263 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.03 
 
 
604 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  32.44 
 
 
663 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.93 
 
 
867 aa  322  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  33.63 
 
 
606 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.98 
 
 
600 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  32.14 
 
 
600 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  42 
 
 
577 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.93 
 
 
574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  36.22 
 
 
537 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  38.86 
 
 
579 aa  293  8e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.54 
 
 
593 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  31.38 
 
 
593 aa  291  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  32.31 
 
 
620 aa  290  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  35.21 
 
 
594 aa  285  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.53 
 
 
611 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.89 
 
 
253 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.18 
 
 
612 aa  260  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.22 
 
 
958 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.79 
 
 
547 aa  253  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.39 
 
 
253 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  48.95 
 
 
241 aa  246  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2501  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  42.5 
 
 
427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.9 
 
 
243 aa  236  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.62 
 
 
598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.63 
 
 
236 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  51.59 
 
 
777 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.63 
 
 
240 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.61 
 
 
250 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.62 
 
 
596 aa  230  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.08 
 
 
240 aa  229  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.41 
 
 
810 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.95 
 
 
242 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.25 
 
 
567 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.15 
 
 
520 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  30.78 
 
 
574 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.55 
 
 
241 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.28 
 
 
241 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.28 
 
 
241 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.75 
 
 
244 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.28 
 
 
241 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.28 
 
 
241 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  45.57 
 
 
238 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  43.85 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.9 
 
 
240 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.9 
 
 
240 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.47 
 
 
240 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  43.25 
 
 
458 aa  217  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.8 
 
 
601 aa  217  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  53.56 
 
 
241 aa  216  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  51.82 
 
 
797 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.58 
 
 
567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.03 
 
 
595 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.58 
 
 
577 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.42 
 
 
572 aa  213  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  47.39 
 
 
772 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.77 
 
 
581 aa  213  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.77 
 
 
564 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.72 
 
 
469 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.3 
 
 
560 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.81 
 
 
435 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.47 
 
 
565 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  44.05 
 
 
423 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  43.68 
 
 
287 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.44 
 
 
451 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.43 
 
 
264 aa  207  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  44.53 
 
 
326 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  43.08 
 
 
329 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  43.08 
 
 
329 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.78 
 
 
776 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  42.51 
 
 
331 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.98 
 
 
569 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.98 
 
 
569 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  33.81 
 
 
579 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.17 
 
 
568 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  47.26 
 
 
238 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.55 
 
 
222 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.22 
 
 
472 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.02 
 
 
328 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.49 
 
 
327 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3540  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  43.38 
 
 
347 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0040  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  36.36 
 
 
353 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  50.61 
 
 
787 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  40 
 
 
267 aa  197  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.76 
 
 
331 aa  196  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  44.04 
 
 
347 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1226  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.88 
 
 
260 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627427  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.75 
 
 
329 aa  195  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2993  cobalamin biosynthesis protein CbiG, putative  38.04 
 
 
351 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.91 
 
 
331 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>