More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4616 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  80.25 
 
 
560 aa  879    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  80.11 
 
 
565 aa  877    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.29 
 
 
572 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  73.18 
 
 
567 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  73.98 
 
 
567 aa  802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1644  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.25 
 
 
568 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.449752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2251  precorrin-3 methylase CobJ  67.56 
 
 
559 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  75.67 
 
 
567 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
563 aa  1125    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  61.7 
 
 
577 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.63 
 
 
569 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  81.61 
 
 
560 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  59.16 
 
 
595 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  65.47 
 
 
559 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  62.63 
 
 
569 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  64.26 
 
 
551 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  60.42 
 
 
579 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  61.36 
 
 
571 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  60.1 
 
 
604 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  58.21 
 
 
564 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  63.6 
 
 
567 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  58.04 
 
 
581 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.51 
 
 
572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2401  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  56.83 
 
 
603 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.346168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1964  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  56.49 
 
 
609 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.0059867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  49.21 
 
 
574 aa  518  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  43.79 
 
 
566 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.17 
 
 
612 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  67.47 
 
 
258 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1947  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-3B C17-methyltransferase  61.52 
 
 
616 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2110  precorrin-3b C17-methyltransferase  61.21 
 
 
619 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.571723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1164  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  60.91 
 
 
614 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0149118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0893  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.91 
 
 
616 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.461845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0267  precorrin-3B C17-methyltransferase  60.91 
 
 
616 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1605  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  60.91 
 
 
616 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.36 
 
 
601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.8 
 
 
481 aa  286  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1886  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.06 
 
 
253 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2378  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.82 
 
 
253 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3180  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.63 
 
 
253 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179883  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6022  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.82 
 
 
254 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00898196  normal  0.131608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0804  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.36 
 
 
261 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2318  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.61 
 
 
253 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.39 
 
 
257 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.84 
 
 
279 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2524  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  52.53 
 
 
495 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564882  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2487  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  51.75 
 
 
495 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2536  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.4 
 
 
242 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2532  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  51.75 
 
 
495 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.502246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0338  precorrin-3 methyltransferase  52.55 
 
 
262 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5689  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 
256 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1521  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.26 
 
 
244 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.23 
 
 
253 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1471  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.65 
 
 
244 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3148  precorrin-3 methyltransferase  51 
 
 
255 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7177  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.41 
 
 
254 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  0.140897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2824  precorrin-3 methyltransferase  55.24 
 
 
244 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2927  precorrin-3 methyltransferase  53.63 
 
 
250 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  hitchhiker  0.0033865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3431  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.54 
 
 
495 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.201044  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1710  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.8 
 
 
253 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.0273239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1432  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.2 
 
 
258 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.688222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2214  precorrin-3 methyltransferase  50.59 
 
 
273 aa  231  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3282  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.78 
 
 
282 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776129  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3104  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.84 
 
 
492 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1435  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.39 
 
 
253 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2815  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.6 
 
 
254 aa  226  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5595  Precorrin-3B methylase-like protein  53.19 
 
 
509 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0773745  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.64 
 
 
778 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.69 
 
 
490 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3264  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.15 
 
 
259 aa  224  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.86 
 
 
800 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.28 
 
 
495 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 
516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  31.8 
 
 
537 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2442  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.78 
 
 
283 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0456628  normal  0.0730106 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  31.15 
 
 
579 aa  213  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.69 
 
 
258 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5848  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.55 
 
 
277 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.528372  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  49.59 
 
 
511 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12102  bifunctional protein, cobI-cobJ fusion protein: S-adenosyl-L-methionine-precorrin-2 methyl transferase + precorrin-3 methylase  48.86 
 
 
508 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274477  normal  0.708984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1521  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  50.2 
 
 
526 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0252228  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  33.87 
 
 
561 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.12 
 
 
867 aa  206  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  30 
 
 
620 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1624  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.81 
 
 
529 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.692931 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  42.97 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.02 
 
 
500 aa  197  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0574  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.48 
 
 
523 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
837 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.62 
 
 
623 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.71 
 
 
623 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.61 
 
 
810 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2892  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  46.61 
 
 
507 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.34 
 
 
469 aa  191  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  39.27 
 
 
241 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.48 
 
 
472 aa  189  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17670  precorrin-2 C20-methyltransferase  47.56 
 
 
510 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0155473  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
243 aa  187  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3409  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  45.42 
 
 
526 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.96 
 
 
631 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>