More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0213 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  100 
 
 
468 aa  962    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  59.57 
 
 
469 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  55.81 
 
 
472 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.45 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 
778 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  50.21 
 
 
663 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.86 
 
 
243 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.38 
 
 
800 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.57 
 
 
629 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  48.57 
 
 
620 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.95 
 
 
241 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.95 
 
 
241 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.6 
 
 
623 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.64 
 
 
623 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.52 
 
 
241 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.53 
 
 
537 aa  233  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.52 
 
 
241 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.68 
 
 
241 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.75 
 
 
263 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.31 
 
 
253 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.47 
 
 
240 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.22 
 
 
837 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.47 
 
 
240 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.33 
 
 
520 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.71 
 
 
631 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  45.97 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  44.08 
 
 
594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  47.49 
 
 
772 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  47.49 
 
 
776 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.18 
 
 
596 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.89 
 
 
240 aa  216  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  45.97 
 
 
777 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.21 
 
 
810 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  45.71 
 
 
579 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  42.31 
 
 
331 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  44.73 
 
 
241 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.15 
 
 
240 aa  209  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  49.59 
 
 
797 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.06 
 
 
244 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  44.73 
 
 
238 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  44.21 
 
 
561 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  41.86 
 
 
329 aa  204  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  41.86 
 
 
329 aa  204  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.77 
 
 
284 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  42.8 
 
 
458 aa  203  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.87 
 
 
567 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  43.09 
 
 
593 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.68 
 
 
593 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.42 
 
 
604 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.81 
 
 
867 aa  200  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.44 
 
 
236 aa  200  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  43.08 
 
 
567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  43.85 
 
 
655 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.97 
 
 
563 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.4 
 
 
245 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.32 
 
 
600 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41 
 
 
600 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.31 
 
 
331 aa  196  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  43.55 
 
 
287 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.53 
 
 
258 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.31 
 
 
327 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  43.55 
 
 
566 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  41 
 
 
240 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 
242 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  39.68 
 
 
326 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.28 
 
 
560 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  43.87 
 
 
567 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.29 
 
 
565 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  42.57 
 
 
267 aa  189  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  40.57 
 
 
606 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  47.45 
 
 
787 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.86 
 
 
250 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  42.97 
 
 
551 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.92 
 
 
328 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.86 
 
 
560 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.83 
 
 
236 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.46 
 
 
435 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  44.05 
 
 
258 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.75 
 
 
572 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.35 
 
 
329 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  41.04 
 
 
574 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 
481 aa  183  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 
581 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  43.92 
 
 
564 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.69 
 
 
612 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.11 
 
 
611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.39 
 
 
574 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.11 
 
 
264 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.5 
 
 
577 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.39 
 
 
577 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  44.3 
 
 
238 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.8 
 
 
266 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  40.87 
 
 
604 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.29 
 
 
569 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.71 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.29 
 
 
569 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.89 
 
 
222 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.63 
 
 
571 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.11 
 
 
320 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0297  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.89 
 
 
245 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.48516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>