More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2702 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  100 
 
 
574 aa  1093    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  89.08 
 
 
577 aa  908    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  61.23 
 
 
611 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  55.32 
 
 
561 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.63 
 
 
958 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  69.64 
 
 
810 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.49 
 
 
800 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.71 
 
 
778 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.04 
 
 
623 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.22 
 
 
623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.69 
 
 
631 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  34.26 
 
 
663 aa  307  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.79 
 
 
837 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  39.09 
 
 
655 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  37.41 
 
 
537 aa  293  7e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  36.94 
 
 
620 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.33 
 
 
593 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  33.15 
 
 
593 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.36 
 
 
867 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.62 
 
 
547 aa  281  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.99 
 
 
629 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.87 
 
 
612 aa  276  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.58 
 
 
600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  29.89 
 
 
606 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  29.77 
 
 
600 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  30.04 
 
 
604 aa  260  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  36.94 
 
 
594 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  36.59 
 
 
579 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  32.98 
 
 
574 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0607  precorrin-3 methyltransferase  34.48 
 
 
567 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.07 
 
 
284 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  33.96 
 
 
567 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.16 
 
 
567 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  43.39 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.05 
 
 
601 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.83 
 
 
240 aa  214  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  33.63 
 
 
581 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.34 
 
 
563 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  33.63 
 
 
564 aa  211  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.56 
 
 
240 aa  210  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.67 
 
 
240 aa  210  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.85 
 
 
451 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.56 
 
 
240 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.33 
 
 
565 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.59 
 
 
263 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.61 
 
 
241 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.57 
 
 
560 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.61 
 
 
241 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.61 
 
 
241 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.61 
 
 
241 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.61 
 
 
241 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.84 
 
 
240 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.62 
 
 
469 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.44 
 
 
253 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  47.46 
 
 
236 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  29.93 
 
 
566 aa  193  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  46.18 
 
 
331 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.55 
 
 
572 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.87 
 
 
572 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  42.26 
 
 
241 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.55 
 
 
560 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  51.04 
 
 
797 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.79 
 
 
567 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.91 
 
 
250 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.22 
 
 
772 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.08 
 
 
243 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.67 
 
 
242 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.32 
 
 
244 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.09 
 
 
777 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.82 
 
 
776 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  41.18 
 
 
238 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.11 
 
 
481 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.75 
 
 
331 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  44.9 
 
 
329 aa  180  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  44.9 
 
 
329 aa  180  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4821  precorrin-3 methyltransferase  35.7 
 
 
579 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  41.87 
 
 
458 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.56 
 
 
596 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.68 
 
 
472 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  42.91 
 
 
287 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  42.86 
 
 
326 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  32.91 
 
 
551 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  42.45 
 
 
423 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.38 
 
 
571 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.86 
 
 
577 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.46 
 
 
610 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  41.46 
 
 
419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.31 
 
 
327 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.76 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.05 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  50 
 
 
787 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  39.6 
 
 
267 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1080  precorrin-3 methyltransferase  43.78 
 
 
253 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.96 
 
 
520 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.51 
 
 
236 aa  171  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  50.42 
 
 
241 aa  171  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.94 
 
 
265 aa  170  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3511  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 
257 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487235  normal  0.723909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.23 
 
 
329 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3606  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  38.15 
 
 
347 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>