More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4162 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
958 aa  1820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  51.28 
 
 
561 aa  482  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2702  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.87 
 
 
574 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2520  precorrin-3B C17-methyltransferase  53.03 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1317  precorrin-3B C17-methyltransferase  52.59 
 
 
611 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.48 
 
 
268 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  73.08 
 
 
298 aa  355  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  67.21 
 
 
275 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  65.68 
 
 
308 aa  342  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.08 
 
 
631 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.06 
 
 
623 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.06 
 
 
623 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.51 
 
 
257 aa  292  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.12 
 
 
778 aa  283  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  30.07 
 
 
663 aa  281  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.24 
 
 
800 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.16 
 
 
629 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.85 
 
 
598 aa  264  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  56.6 
 
 
810 aa  262  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.05 
 
 
837 aa  259  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.52 
 
 
867 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  36.87 
 
 
655 aa  250  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  31.12 
 
 
593 aa  249  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  27.95 
 
 
604 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  30.95 
 
 
593 aa  248  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  26.43 
 
 
600 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.12 
 
 
612 aa  234  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0802  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.18 
 
 
547 aa  232  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0804272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  26.82 
 
 
600 aa  230  7e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.98 
 
 
251 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  30.12 
 
 
620 aa  229  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  32.83 
 
 
537 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.54 
 
 
261 aa  225  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1617  precorrin-3 methyltransferase  27.26 
 
 
606 aa  224  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.481163  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  32.26 
 
 
579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
610 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  49.8 
 
 
271 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.04 
 
 
254 aa  211  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  33.72 
 
 
594 aa  211  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5858  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  54.01 
 
 
377 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.097759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.8 
 
 
251 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
252 aa  206  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.4 
 
 
253 aa  206  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.61 
 
 
264 aa  205  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0175  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.75 
 
 
601 aa  205  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.63 
 
 
626 aa  205  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.53 
 
 
272 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.8 
 
 
248 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.73 
 
 
271 aa  204  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 
258 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.75 
 
 
258 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.24 
 
 
258 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 
267 aa  202  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.92 
 
 
261 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.3 
 
 
248 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 
252 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.19 
 
 
257 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
253 aa  198  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 
259 aa  198  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.03 
 
 
255 aa  196  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.13 
 
 
256 aa  196  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.97 
 
 
262 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.43 
 
 
273 aa  196  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.9 
 
 
251 aa  195  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  42.17 
 
 
614 aa  194  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 
266 aa  194  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.31 
 
 
251 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 
254 aa  194  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 
261 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  37.5 
 
 
251 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.07 
 
 
287 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 
254 aa  191  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  43.77 
 
 
331 aa  191  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 
305 aa  190  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  41.2 
 
 
251 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 
257 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 
257 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 
257 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1552  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.37 
 
 
283 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.886587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 
257 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.87 
 
 
254 aa  189  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 
261 aa  187  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  35.89 
 
 
251 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
254 aa  187  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 
257 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.62 
 
 
581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.78 
 
 
626 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.37 
 
 
261 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.02 
 
 
241 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
251 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.64 
 
 
241 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.08 
 
 
251 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.02 
 
 
241 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  32.62 
 
 
564 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.13 
 
 
259 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.64 
 
 
241 aa  186  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
252 aa  185  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.64 
 
 
241 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.36 
 
 
254 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  39.54 
 
 
423 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>